根据分析目标、色谱柱的类型、气相色谱仪的操作顺序和详细的检测器，如果使用不合格的低纯度气体，可能会产生如下不良影响:

　　1.样品变形或消失:例如，H2O气体水解氯硅样品；2.色谱柱故障:H2O和CO2使分子筛柱失活，H2O气体分解聚酯固定液，O2使PEG链断裂。
　　3.有时，一些气体杂质会与固定液相互作用，产生假峰。
　　4.对色谱柱存储特性的影响:例如，H2O在聚乙二醇等亲水性固定液上的存储指数会增加。当载气中氧含量过高时，累积型和非累积型固定液柱的储存特性都会发生变化，应用时间越长，影响越大。
　　5.检测器:
　　6.TCD:信噪比降低，无法调节，线性变窄，无法使用文献中的校对因子，含氧量过高，在高温下加速元器件老化，缩短寿命。
　　7.FID:特别是在DT≤1ⅹ10⒒/s运行时，CH4等有机杂质会使基本流量激增，噪音增大，无法进行微量分析。
　　8.ECD:载气中的氧气和水对检测器的正常工作有很大影响。在不同的供电方式中，脉冲电源比DC电压电源影响更大，固定基极电流脉冲调制电源比脉冲电源影响更大。这就是为什么当许多ECD以固定基流脉冲调制运行时，当载气纯度较低时，有必要将载气纯度选择器开关从“标准氮气”切换到“普通氮气”。